双方签订合伙协议，但对外是以个体工商户的形式从事经营，发生法律纠纷时，如果债务人不知道有合伙协议及合伙人的存在，可以直接起诉个体工商户上登记的负责人，要求其承担法律责任，而合伙人之间责任分担则依据双方之间签订的《合伙协议》；如果债权人知道有合伙协议以及合伙人实际参与共同经营，在发生法律纠纷时，就应当根据合伙协议约定来处理。